Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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