Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DCAF5-202ENST00000389997 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 DCAF5-207ENST00000556111 728 ntTSL 310.67□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 43.5
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PCBP2Q15366 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 43.5
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PCBP2Q15366 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 43.5
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PCBP2Q15366 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 43.5
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PCBP2Q15366 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 56.83□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 UBAP2-202ENST00000379225 1809 ntTSL 213.6□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 CANT1-215ENST00000592887 555 ntTSL 415.94■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 43.5
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PCBP2Q15366 LAMA5-214ENST00000497363 579 ntTSL 315.48■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 43.5
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PCBP2Q15366 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 27.56□□□□□ -1.28e-29■■■■■ 43.5
PCBP2Q15366 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.388e-29■■■■■ 43.5
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PCBP2Q15366 EP400-201ENST00000330386 3908 ntTSL 211.28□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 43.4
PCBP2Q15366 EP400-207ENST00000611739 4314 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 43.4
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PCBP2Q15366 POU2F1-214ENST00000559038 557 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-12■■■■■ 43.4
PCBP2Q15366 PXN-209ENST00000540221 550 ntTSL 48.64□□□□□ -1.032e-12■■■■■ 43.4
PCBP2Q15366 PXN-218ENST00000551327 588 ntTSL 48.24□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 43.4
PCBP2Q15366 POU2F1-207ENST00000442313 496 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-12■■■■■ 43.4
PCBP2Q15366 SLC39A11-212ENST00000582179 568 ntTSL 415.35■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 43.4
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PCBP2Q15366 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.364e-9■■■■■ 43.4
PCBP2Q15366 PTK2-251ENST00000523797 405 ntTSL 320.92■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 PTK2-256ENST00000524257 430 ntTSL 410□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 PTK2-214ENST00000519635 578 ntTSL 48.32□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 PTK2-249ENST00000523679 504 ntTSL 37.04□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 29.25□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 COMMD5-205ENST00000530332 1329 ntTSL 215.4■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 KLHL23-206ENST00000498202 843 ntTSL 316.47■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 KLHL23-203ENST00000437875 895 ntTSL 36.49□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.793e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 43.3
PCBP2Q15366 WDR45B-203ENST00000571817 889 ntTSL 319.08■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 WDR45B-208ENST00000574828 765 ntTSL 314.72□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 WDR45B-205ENST00000572583 2322 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 WDR45B-206ENST00000573616 896 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 310.98□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 58.4□□□□□ -1.063e-26■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 PTBP2-208ENST00000476783 779 ntTSL 1 (best)5.41□□□□□ -1.543e-26■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)5.13□□□□□ -1.593e-26■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 TP53-206ENST00000455263 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 43.2
PCBP2Q15366 TP53-219ENST00000610538 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 43.2
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