Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms