Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-203ENST00000525208 691 ntTSL 313□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-205ENST00000557236 631 ntTSL 512.27□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-218ENST00000593103 562 ntTSL 512.06□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-208ENST00000590288 734 ntTSL 412.04□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-203ENST00000585989 568 ntTSL 412.04□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 211.95□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-212ENST00000591697 613 ntTSL 411.89□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-202ENST00000524846 3462 ntTSL 211.87□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-204ENST00000556599 548 ntTSL 311.32□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-217ENST00000592378 533 ntTSL 411.31□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-211ENST00000591255 545 ntTSL 410.73□□□□□ -0.691e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-210ENST00000531173 854 ntTSL 210.31□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.961e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-PABPN1-202ENST00000556100 655 ntTSL 38.31□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 METTL17-222ENST00000556733 510 ntTSL 57.88□□□□□ -1.151e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.833e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 COL9A3-204ENST00000463487 760 ntTSL 512.14□□□□□ -0.473e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.631e-8■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-8■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 34.79□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.221e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.861e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-204ENST00000430075 586 ntTSL 49.55□□□□□ -0.881e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.551e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.593e-7■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 23.23□□□□□ -1.893e-7■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 210.64□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 24.69□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-14■□□□□ 10
SRSF9Q13242 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-14■□□□□ 10
SRSF9Q13242 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.454e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 FMO5-204ENST00000478432 1606 ntTSL 25.88□□□□□ -1.474e-9■□□□□ 10
SRSF9Q13242 FMO5-207ENST00000533848 618 ntTSL 45.22□□□□□ -1.574e-9■□□□□ 10
SRSF9Q13242 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-201ENST00000413969 545 ntTSL 310.41□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-203ENST00000417086 984 ntTSL 29.38□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-205ENST00000436126 945 ntTSL 47.79□□□□□ -1.162e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 ACIN1-217ENST00000555566 734 ntTSL 37.42□□□□□ -1.222e-8■□□□□ 10
SRSF9Q13242 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 HS1BP3-206ENST00000446825 841 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.212e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 FKBP10-206ENST00000489591 2826 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 FKBP10-205ENST00000487489 578 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 PRKAR1A-216ENST00000589017 1116 ntTSL 311.51□□□□□ -0.577e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.17e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 46.19□□□□□ -1.427e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 05e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-206ENST00000531030 805 ntTSL 311.27□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-203ENST00000526383 786 ntTSL 58.57□□□□□ -1.045e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-209ENST00000562396 1681 nt14.5□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-217ENST00000530534 844 ntTSL 211.31□□□□□ -0.63e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.763e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-216ENST00000569900 559 ntTSL 410.12□□□□□ -0.793e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 AP000347.1-206ENST00000437862 515 ntTSL 39.87□□□□□ -0.833e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 49.41□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-215ENST00000529840 820 ntTSL 57.74□□□□□ -1.173e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-210ENST00000527852 582 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 27.23□□□□□ -1.253e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 MIR194-2-201ENST00000384864 85 ntBASIC6.9□□□□□ -1.33e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-210ENST00000562527 625 ntTSL 36.44□□□□□ -1.383e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ZNF217-203ENST00000431687 779 ntTSL 55.82□□□□□ -1.483e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-217ENST00000569939 564 ntTSL 45.52□□□□□ -1.533e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 34.53□□□□□ -1.683e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 43.41□□□□□ -1.863e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-214ENST00000566316 576 ntTSL 21.53□□□□□ -2.163e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 9.7
Retrieved 100 of 3,885 protein–RNA pairs in 366.9 ms