Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTP4A2Q12974 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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