Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP11P51784 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP11P51784 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP11P51784 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP11P51784 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP11P51784 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP11P51784 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP11P51784 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP11P51784 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP11P51784 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP11P51784 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP11P51784 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP11P51784 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP11P51784 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP11P51784 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP11P51784 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP11P51784 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP11P51784 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP11P51784 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP11P51784 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP11P51784 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP11P51784 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP11P51784 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms