Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD8P48556 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms