Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VDAC1P21796 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VDAC1P21796 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms