Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RXRAP19793 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RXRAP19793 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRAP19793 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRAP19793 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRAP19793 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRAP19793 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRAP19793 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRAP19793 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRAP19793 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRAP19793 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RXRAP19793 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRAP19793 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRAP19793 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRAP19793 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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