Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	LAP3	YNL239W	1365 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YOL075C	YOL075C	3885 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	POL12	YBL035C	2118 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	DPH6	YLR143W	2058 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	MTC4	YBR255W	2085 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	FMP46	YKR049C	402 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SUI1	YNL244C	327 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SNF8	YPL002C	702 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	ICY2	YPL250C	411 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	HCA4	YJL033W	2313 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SUL2	YLR092W	2682 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	ERB1	YMR049C	2424 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	HIS6	YIL020C	786 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SWP82	YFL049W	1872 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	STV1	YMR054W	2673 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	ERG4	YGL012W	1422 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	RPB2	YOR151C	3675 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	PHM7	YOL084W	2976 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	APP1	YNL094W	1764 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	RFC2	YJR068W	1062 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YLR428C	YLR428C	345 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	CCS1	YMR038C	750 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YPL278C	YPL278C	303 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	TPA1	YER049W	1935 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	UGA3	YDL170W	1587 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	CDC9	YDL164C	2268 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	DIN7	YDR263C	1293 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SNM1	YDR478W	597 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	COS4	YFL062W	1140 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	ORM1	YGR038W	669 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	CAP2	YIL034C	864 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SHE1	YBL031W	1017 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SIW14	YNL032W	846 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	RRP40	YOL142W	723 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	FYV5	YCL058C	459 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	ATG18	YFR021W	1503 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	GUS1	YGL245W	2127 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	MMT1	YMR177W	1533 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	MRP4	YHL004W	1185 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	EFB1	YAL003W	621 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	ISY1	YJR050W	708 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	NSE1	YLR007W	1011 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YDL109C	YDL109C	1944 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	GZF3	YJL110C	1656 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	KTR7	YIL085C	1554 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	AIM21	YIR003W	2040 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YEH2	YLR020C	1617 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	CEG1	YGL130W	1380 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	SAF1	YBR280C	1914 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	GEM1	YAL048C	1989 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	MIG3	YER028C	1185 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SLX8	YER116C	825 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	AAD6	YFL056C	639 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	FRA2	YGL220W	363 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YGR126W	YGR126W	693 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SEC72	YLR292C	582 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RPS1B	YML063W	768 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	VPS68	YOL129W	555 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	UTP23	YOR004W	765 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	FSH3	YOR280C	801 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YOR379C	YOR379C	339 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RER1	YCL001W	567 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SYF1	YDR416W	2580 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	PEX7	YDR142C	1128 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RPL14A	YKL006W	417 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	CNB1	YKL190W	528 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	HEK2	YBL032W	1146 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	VPS69	YPR087W	321 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	FLO8	YER109C	2400 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SPC105	YGL093W	2754 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	MST1	YKL194C	1389 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	ALO1	YML086C	1581 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	PTC1	YDL006W	846 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RPC53	YDL150W	1269 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YHR140W	YHR140W	720 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	REV7	YIL139C	738 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YIL152W	YIL152W	708 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RPP0	YLR340W	939 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	REC114	YMR133W	1287 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RRN9	YMR270C	1098 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	AST1	YBL069W	1290 nt		3.13	□□□□□ -1.91

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