Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASA4O43374 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASA4O43374 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASA4O43374 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASA4O43374 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASA4O43374 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RASA4O43374 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RASA4O43374 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASA4O43374 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASA4O43374 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms