Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFIT3O14879 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFIT3O14879 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFIT3O14879 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms