Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U3KQE9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U3KQE9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
U3KQE9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U3KQE9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
U3KQE9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
U3KQE9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
U3KQE9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
U3KQE9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
U3KQE9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms