Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM5BQ9UGL1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms