Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms