Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms