Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms