Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPRD1AQ96P16 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms