Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC11Q7Z392 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms