Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRIP3Q6Q6R5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms