Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms