Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP25-1Q3LHN0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP25-1Q3LHN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP25-1Q3LHN0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP25-1Q3LHN0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP25-1Q3LHN0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP25-1Q3LHN0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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