Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CTF1Q16619 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CTF1Q16619 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CTF1Q16619 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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