Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC63Q05C16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC63Q05C16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms