Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 ARX1YDR101C 1782 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 RTN1YDR233C 888 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YAE1YJR067C 426 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YNL134CYNL134C 1131 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 CKS1YBR135W 453 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 OM14YBR230C 405 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 ADY3YDL239C 2373 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 STR2YJR130C 1920 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 GIP4YAL031C 2283 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 OPT2YPR194C 2634 nt4.56□□□□□ -1.68
SEC28P40509 MSC2YDR205W 2175 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 IOC4YMR044W 1428 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 TRM13YOL125W 1431 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 RTC1YOL138C 4026 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 STV1YMR054W 2673 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 DCV1YFR012W 609 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 VPS71YML041C 843 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YIF1YNL263C 945 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 PRP19YLL036C 1512 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 PDR5YOR153W 4536 nt4.55□□□□□ -1.68
SEC28P40509 PRM1YNL279W 1986 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 ALG6YOR002W 1635 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 PHO13YDL236W 939 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 ARG82YDR173C 1068 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 RNA15YGL044C 891 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 COA3YJL062W-A 258 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 ATG33YLR356W 594 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 MFA2YNL145W 117 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 ATG8YBL078C 354 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 MAG2YLR427W 2013 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 MIF2YKL089W 1650 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 IDS2YJL146W 1410 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 SRS2YJL092W 3525 nt4.54□□□□□ -1.68
SEC28P40509 MLF3YNL074C 1359 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 BOI2YER114C 3123 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 TFC7YOR110W 1308 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 RNY1YPL123C 1305 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 MMT1YMR177W 1533 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 DCD1YHR144C 939 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 SAP30YMR263W 606 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 NCE102YPR149W 522 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 NUP2YLR335W 2163 nt4.53□□□□□ -1.68
SEC28P40509 RKM3YBR030W 1659 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 TIS11YLR136C 858 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 LTO1YNL260C 597 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YNL296WYNL296W 315 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 snR37snR37 386 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YCL022CYCL022C 516 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 HSP82YPL240C 2130 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 NPL4YBR170C 1743 nt4.52□□□□□ -1.69
SEC28P40509 MIH1YMR036C 1665 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 snR7-SsnR7-S 179 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 TFB3YDR460W 966 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 SRB5YGR104C 924 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 MRP4YHL004W 1185 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YET2YMR040W 483 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 RNA1YMR235C 1224 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PUF2YPR042C 3228 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 EAR1YMR171C 1653 nt4.51□□□□□ -1.69
SEC28P40509 APC1YNL172W 5247 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 UGA3YDL170W 1587 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 BCH2YKR027W 2298 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 ARF2YDL137W 546 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PHO92YDR374C 921 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YIM1YMR152W 1098 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YNR061CYNR061C 660 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 MDM12YOL009C 816 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 UMP1YBR173C 447 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PEX29YDR479C 1665 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 ALG9YNL219C 1668 nt4.5□□□□□ -1.69
SEC28P40509 BOP2YLR267W 1713 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YJR026WYJR026W 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YJR028WYJR028W 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YAR010CYAR010C 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YML040WYML040W 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YMR051CYMR051C 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 RMD1YDL001W 1293 nt4.49□□□□□ -1.69
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