Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB6O95452 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB6O95452 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB6O95452 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB6O95452 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB6O95452 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB6O95452 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB6O95452 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB6O95452 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB6O95452 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB6O95452 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GJB6O95452 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB6O95452 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB6O95452 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB6O95452 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB6O95452 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB6O95452 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB6O95452 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB6O95452 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB6O95452 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB6O95452 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB6O95452 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB6O95452 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB6O95452 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB6O95452 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB6O95452 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB6O95452 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB6O95452 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB6O95452 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB6O95452 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB6O95452 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB6O95452 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB6O95452 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB6O95452 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB6O95452 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB6O95452 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB6O95452 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms