Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPO95166 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms