Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP1O75113 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms