Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNCRIPO60506 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNCRIPO60506 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms