Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP69A5D8W1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms