Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB6Q9Y5E3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB6Q9Y5E3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms