Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HPSEQ9Y251 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms