Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRPC6Q9Y210 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms