Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRNDQ9UKY0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms