Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms