Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASS4Q9NQ75 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASS4Q9NQ75 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms