Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms