Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25Q9BV90 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP25Q9BV90 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms