Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INPP4AQ96PE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INPP4AQ96PE3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms