Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NMD3Q96D46 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms