Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXNL1Q96CM4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms