Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PHKBQ93100 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHKBQ93100 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKBQ93100 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms