Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms