Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms