Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WASHC2DQ5SRD0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WASHC2DQ5SRD0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms