Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYAQ5MJ70 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms