Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FXNQ16595 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FXNQ16595 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FXNQ16595 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FXNQ16595 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FXNQ16595 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FXNQ16595 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FXNQ16595 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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FXNQ16595 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FXNQ16595 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FXNQ16595 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FXNQ16595 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FXNQ16595 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FXNQ16595 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FXNQ16595 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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FXNQ16595 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FXNQ16595 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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FXNQ16595 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FXNQ16595 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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FXNQ16595 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FXNQ16595 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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FXNQ16595 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FXNQ16595 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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FXNQ16595 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FXNQ16595 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FXNQ16595 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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FXNQ16595 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FXNQ16595 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FXNQ16595 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FXNQ16595 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FXNQ16595 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FXNQ16595 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FXNQ16595 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FXNQ16595 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FXNQ16595 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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