Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL19A1Q14993 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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