Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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SCGB2A2Q13296 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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SCGB2A2Q13296 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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SCGB2A2Q13296 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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SCGB2A2Q13296 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SCGB2A2Q13296 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SCGB2A2Q13296 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SCGB2A2Q13296 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SCGB2A2Q13296 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCGB2A2Q13296 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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