Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTP4A2Q12974 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTP4A2Q12974 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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